เจ้าอินทยงยศโชติ มีราชโอรสและราชธิดา รวม 5 พระองค์ ณ ลำพูน มีนามตามลำดับ ดังนี้

• ใน แม่เจ้าหม่อมราชวงศ์รถแก้ว - ธิดาหม่อมเจ้าสัตบุศ อิศรเสนากับเจ้าหญิงในราชวงศ์ทิพย์จักร[3] (มีราชโอรส 1 ราชธิดา 2)

1. เจ้ามุกดา ณ ลำพูน - สมรสกับ "เจ้าราชภาคินัย น้อยเมืองไทย, เจ้าราชภาคินัยนครลำพูน"
2. มหาอำมาตย์โท พลตรี เจ้าจักรคำขจรศักดิ์, เจ้าผู้ครองนครลำพูน องค์ที่ 10
3. เจ้าหล้า ณ ลำพูน - สมรสกับ "เจ้าน้อยจิตตะ ณ ลำพูน" ภายหลังสมรสกับ "เจ้าราชสัมพันธ์วงศ์ น้อยพุทธวงศ์ ณ เชียงใหม่, เจ้าราชสัมพันธ์วงศ์นครลำพูน"

• ใน หม่อมคำเที่ยง (มีราชธิดา 1)
  • เจ้าทิพนวล ณ ลำพูน
• ใน หม่อมบัวจีน (มีราชธิดา 1)
  • เจ้าสายเขียว ณ ลำพูน
• ใน หม่อมขันคำ (ไม่มีราชโอรส ราชธิดา)